FIFA 2001 trajo consigo, por primera vez, los escudos oficiales de los equipos en los uniformes de las ligas que cedieron la licencia. También fue el primero de la serie con una «barra de poder» para calibrar la potencia de los tiros al arco.
En la siguiente versión las barras de poder fueron implementadas para los pases y la velocidad de los jugadores se redujo un poco para aumentar el desafío para los gamers. Lo más llamativo de esta versión fue la adición de tarjetas de recompensa, licenciadas por Panini, desbloqueables después de ganar competencias determinadas. FIFA 2002 sería el último de los juegos en tener en su repertorio a la selección nacional de Japón, ya que la federación japonesa de fútbol vendió los derechos de exclusividad a Konami, desarrollador de videojuegos rival de EA Sports.
FIFA 2003 introdujo un cambio sustancial en la interfaz respecto a sus predecesores y obtuvo nuevas y mejoradas gráficas que permitieron un mayor nivel de detalle en estadios, jugadores y uniformes. «Club Championship» fue nombre de un nuevo modo de juego que consistía en una competencia entre los mejores 17 equipos de Europa, con sus propios estadios, cantos de los fanáticos y canciones. Además, en el medio tiempo y al finalizar los partidos, aparecieron por primera vez las jugadas más destacadas y estadísticas muy similares a una transmisión por televisión. FIFA 2003 también fue el primer juego de la serie en utilizar EA Trax, un sistema exclusivo de música implementado para la banda sonora del juego.
